一、克隆病
本病的臨床表現(xiàn)和X線征象與腸結核極為酷似，有時甚難鑒別，可借助下列幾點協(xié)助診斷。
?、俦静o肺結核或腸外結核病史。
?、诓〕桃话愀L，不經(jīng)抗結核治療可出現(xiàn)間斷緩解。
③糞便及其它體液及分泌物檢查無結核菌。
④X線檢查可見病變以回腸末端為主，有多段腸曲受累，并呈節(jié)段性分布。
?、菽c梗阻、糞瘺等并發(fā)癥較腸結核更為多見。
?、耷谐∽兡c段作病理檢查無干酪樣壞死，鏡檢與動物接種均無結核桿菌。
二、右側結腸癌
?、俦静“l(fā)病年齡多為40歲以上中老年人。
?、跓o長期低熱、盜汗等結核毒血癥及結核病史。
?、鄄∏檫M行性加重，消瘦、蒼白、無力等全身癥狀明顯。
?、芨共磕[塊開始出現(xiàn)時移動性稍大且無壓痛，但較腸結核腫塊表面堅硬，結節(jié)感明顯。
?、軽線檢查主要有鋇劑充盈缺損，病變局限，不累及回腸。
?、弈c梗阻較早、較多出現(xiàn)。
?、呃w維結腸鏡檢可窺見腫瘤，活檢常可確診。在臨床上結腸癌的發(fā)病率較腸結核為高。
三、阿米巴或血吸蟲病性肉芽腫
腸阿米巴或血吸蟲病可形成肉芽腫病變，在鑒別診斷上應注意。該類疾病無結核病史，膿血便較常見，糞便中發(fā)現(xiàn)有關的病原體，直腸及結腸鏡?？勺C實診斷，相應的特異性治療有效。
四、其他疾病
除上述疾病外，腸結核尚應與下列疾病鑒別。以腹痛、腹瀉為主要表現(xiàn)者應與腹型淋巴瘤、腸放線菌病相鑒別。以急性右下腹劇痛為主要表現(xiàn)者應注意避免誤診為急性闌尾炎。以慢性腹痛牽扯上腹部者易與消化性潰瘍、慢性膽囊炎混淆。有稽留高熱者需排除傷寒。